Автономные контроллеры в основном используются в простых системах контроля доступа. Контроллер может быть оборудован клавиатурой для ввода кодов доступа и программирования. Автономные контроллеры используются для защиты одного прохода. Но также есть модели, которые рассчитаны на 4 и более считывателей и клавиатур, что позволяет использовать их для защиты 2 и более проходов. Для блокировки прохода к автономным контроллерам используются электромагнитные и электромеханические замки.
Данные о регистрационных кодах сохраняются во встроенной памяти контроллера. Благодаря этому контроллер не нужно подключать к сети для передачи данных, что повышает надёжность от взлома базы данных. Регистрационные коды вводятся на клавиатуре, и контроллер принимает решение, открыть или заблокировать доступ, поднять тревогу, поставить или снять с охраны.
Автономные контроллеры могут быть подключены к источнику бесперебойного питания для решения проблем с перебоями питания и повышения отказоустойчивости.
Недостатки автономных контроллеров заключаются в том, что их нельзя подключить к компьютеру для управления и мониторинга. С автономными контроллерами не получится вести учёт рабочего времени сотрудников, просмотреть архивы, получить данные о перемещениях пользователей карт. Данные функции возможны только с использованием сетевых контроллеров СКУД.